MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylobacterium radiotolerans JCM 2831 plasmid pMRAD06

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010502	AGT	2	6	906	911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010502	GGT	2	6	922	927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010502	TA	3	6	967	972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010502	GCAG	2	8	981	988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010502	GTCT	2	8	1025	1032	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010502	TGG	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010502	CGA	2	6	1511	1516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010502	ATG	2	6	2324	2329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010502	AAG	2	6	2337	2342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010502	CG	3	6	2344	2349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010502	CG	3	6	2351	2356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010502	GGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010502	AGCTG	2	10	2768	2777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010502	CCCTT	2	10	2842	2851	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_010502	GCC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_010502	CGA	2	6	2927	2932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010502	CTACA	2	10	3545	3554	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_010502	ACT	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010502	GGA	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010502	GTG	2	6	3615	3620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010502	GGC	2	6	3644	3649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010502	GA	3	6	3653	3658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010502	GC	3	6	3674	3679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010502	GCC	2	6	3750	3755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010502	GGC	2	6	3759	3764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010502	ACC	2	6	3879	3884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_010502	CGG	2	6	3905	3910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010502	GGC	2	6	3921	3926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010502	GGGCAG	2	12	3946	3957	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_010502	CGG	3	9	3995	4003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010502	GCG	2	6	4026	4031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010502	GCC	2	6	4034	4039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010502	AGC	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010502	CCG	2	6	4052	4057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_010502	ACT	2	6	4973	4978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010502	ACGA	2	8	4993	5000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010502	GC	3	6	5043	5048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010502	TCC	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_010502	TCG	2	6	5080	5085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010502	GCG	2	6	5200	5205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010502	G	6	6	5212	5217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010502	ATC	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010502	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010502	GCC	2	6	5447	5452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_010502	CGT	2	6	5459	5464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010502	CGG	2	6	5473	5478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010502	CGG	2	6	6067	6072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010502	ATG	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010502	TCG	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010502	TCC	2	6	6175	6180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010502	GCCA	2	8	9925	9932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010502	GAA	2	6	9958	9963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010502	GGCT	2	8	9993	10000	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010502	GCC	2	6	10010	10015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_010502	CGC	3	9	10096	10104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010502	GGA	2	6	10123	10128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010502	AGC	2	6	10141	10146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010502	AGC	2	6	10174	10179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010502	TCG	2	6	10203	10208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010502	CGC	2	6	10220	10225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_010502	GGC	2	6	10234	10239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010502	TCC	2	6	10343	10348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_010502	GTC	2	6	10425	10430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010502	GC	3	6	10431	10436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_010502	CGC	2	6	10442	10447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_010502	GTG	2	6	10456	10461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010502	AGC	2	6	10504	10509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010502	CG	3	6	10779	10784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010502	TGCGGC	2	12	10785	10796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010502	CCGG	2	8	10816	10823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010502	GAG	2	6	11846	11851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010502	CTC	2	6	11890	11895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010502	G	6	6	11906	11911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010502	ATC	2	6	11946	11951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010502	GTC	2	6	12003	12008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010502	GCT	2	6	12017	12022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010502	TCG	2	6	12049	12054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010502	GAT	2	6	12966	12971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010502	GCGCC	2	10	12991	13000	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_010502	CAG	2	6	13030	13035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010502	CCA	2	6	13046	13051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_010502	GCAG	2	8	13092	13099	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010502	CCA	2	6	13196	13201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_010502	AGG	2	6	13256	13261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010502	CCG	2	6	13269	13274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010502	GAT	2	6	13367	13372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010502	AAT	2	6	13450	13455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010502	TCA	2	6	13470	13475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010502	CCG	2	6	13491	13496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010502	GCA	2	6	13681	13686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010502	GCG	3	9	13756	13764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010502	AGCGGC	2	12	13805	13816	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010502	CCGGAC	2	12	13902	13913	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010502	GCC	2	6	13958	13963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010502	GC	3	6	13967	13972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010502	AG	3	6	14012	14017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010502	GCG	2	6	14067	14072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010502	TGC	2	6	14093	14098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010502	ACG	2	6	14119	14124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010502	GTC	2	6	14127	14132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010502	GCC	2	6	14163	14168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010502	AGC	2	6	14237	14242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010502	AGC	2	6	14259	14264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010502	GAGCT	2	10	14268	14277	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_010502	GGC	2	6	14289	14294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010502	CGC	2	6	14379	14384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010502	GTA	2	6	14386	14391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010502	GCC	2	6	14618	14623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010502	AGC	2	6	14639	14644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010502	CGTG	2	8	14679	14686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010502	GCC	2	6	14700	14705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010502	CAG	2	6	14716	14721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010502	GAGC	2	8	14844	14851	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010502	CGG	2	6	14886	14891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010502	GGCT	2	8	14959	14966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010502	G	7	7	15043	15049	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010502	GGCC	2	8	15166	15173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010502	CGC	2	6	15219	15224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010502	CCG	2	6	15256	15261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_010502	CGA	2	6	15318	15323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010502	CCGC	2	8	15574	15581	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_010502	ATCA	2	8	15603	15610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010502	AAT	2	6	15674	15679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010502	TAA	2	6	15702	15707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010502	GA	3	6	15792	15797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010502	CTA	2	6	15813	15818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010502	TGC	2	6	15822	15827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010502	GAG	2	6	15913	15918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010502	TTTA	2	8	15926	15933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010502	AAT	2	6	15934	15939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010502	C	7	7	15943	15949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
132	NC_010502	T	6	6	15951	15956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010502	TA	4	8	15985	15992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010502	CAG	2	6	16027	16032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010502	AAAT	2	8	16104	16111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010502	ATA	2	6	16137	16142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010502	GCTT	2	8	16231	16238	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010502	GTAAC	2	10	16254	16263	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010502	ACCTT	2	10	16288	16297	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_010502	C	7	7	16350	16356	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
141	NC_010502	ACA	2	6	16370	16375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010502	CAG	2	6	16427	16432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_010502	TTTC	2	8	16494	16501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010502	GTT	2	6	16518	16523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010502	ACG	2	6	16554	16559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010502	TGGG	2	8	16598	16605	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010502	ATG	2	6	16655	16660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010502	TGT	2	6	16725	16730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010502	AATC	2	8	16839	16846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010502	AGA	2	6	16856	16861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010502	CGAT	2	8	16862	16869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010502	AC	3	6	16910	16915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010502	CAA	2	6	16922	16927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010502	TCT	2	6	16972	16977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_010502	CGA	2	6	17025	17030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_010502	ACG	2	6	17108	17113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_010502	A	6	6	17123	17128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010502	A	7	7	17180	17186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_010502	GGA	2	6	17230	17235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010502	GGA	2	6	17257	17262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010502	CGG	2	6	17283	17288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_010502	GGAT	2	8	17298	17305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010502	GAT	2	6	17359	17364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010502	A	7	7	17367	17373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010502	GGC	2	6	17386	17391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_010502	TTA	2	6	17406	17411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010502	GGA	2	6	17656	17661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010502	GGC	2	6	17676	17681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_010502	TAG	2	6	17699	17704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010502	TA	3	6	17731	17736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_010502	GCG	2	6	17843	17848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_010502	GGGACT	2	12	17911	17922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_010502	CGGAAC	3	18	17943	17960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_010502	GGGACT	2	12	17995	18006	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
175	NC_010502	CGGAAC	3	18	18027	18044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_010502	CGGAAC	3	18	18105	18122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_010502	CGG	2	6	21717	21722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_010502	GCC	2	6	21739	21744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_010502	GTCG	2	8	25410	25417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
180	NC_010502	GTC	2	6	25441	25446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_010502	AGGA	2	8	25463	25470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010502	CTG	2	6	25552	25557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_010502	CGC	2	6	25667	25672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_010502	TCG	2	6	25740	25745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_010502	CAG	2	6	25761	25766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_010502	GTC	2	6	25778	25783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_010502	GCA	2	6	25799	25804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_010502	CTC	2	6	27027	27032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.